33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1945 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1945  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  361  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  30.17 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  30.17 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  25.28 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  24.57 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  32.58 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  26.79 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  32.14 
 
 
239 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  32.14 
 
 
239 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  30.7 
 
 
239 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  31.09 
 
 
240 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  31.58 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  31.43 
 
 
236 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  30.49 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  29 
 
 
258 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  30.91 
 
 
227 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  24.85 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  27.73 
 
 
216 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1232  hypothetical protein  29.7 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000655533  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  28.44 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0038  hypothetical protein  36.67 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177426  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4922  hypothetical protein  22.86 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131667  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  25.49 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  21.55 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>