15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0065 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0009  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00283898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0042  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.312385  decreased coverage  0.0044005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0062  5S ribosomal RNA  99.15 
 
 		 117 bp  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0037  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.824918  normal  0.016931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0052  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 116 bp  69.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.306007  normal  0.0212243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0018  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 120 bp  56  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0034  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 120 bp  56  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.928041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0054  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0055  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0388  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 120 bp  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364559  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3080  5S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 120 bp  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0007  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.718025  normal  0.0200825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0037  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.141863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0052  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 114 bp  44.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.790118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>