80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2513 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2513  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  100 
 
 
295 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  44.44 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.99 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.3 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.83 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  24.28 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.74 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.59 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  33.82 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.89 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.33 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.16 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.39 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.15 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.94 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.09 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  24.22 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  31.76 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.65 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  28.96 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  24.83 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.41 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.59 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  26.01 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  29.3 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  24.91 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  29.3 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.88 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  24.14 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.54 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  22.74 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  22.74 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.68 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  25.22 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.16 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2598  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.17 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.63 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25330  predicted N-acetylglucosamine kinase  32.94 
 
 
380 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261612  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1926  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.13 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.01 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  29.89 
 
 
369 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.53 
 
 
377 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  24.32 
 
 
301 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.99 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.76 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1857  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.66 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.703313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.97 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2066  hypothetical protein  30.29 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.62 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2621  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.04 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.248705  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11050  hypothetical protein  35.16 
 
 
301 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.505129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.61 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0555  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.59 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5366  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.36 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.374079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.61 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.36 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  24.39 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.78 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.28 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  26.16 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.56 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  41.86 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.66 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.09 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.6 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0095  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.47 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.083088  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.37 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.09 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1446  putative sugar kinase  35.47 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.09 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.09 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.49 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4023  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.51 
 
 
382 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.81 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.74 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.91 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.75 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.17 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>