26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4569 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  42.49 
 
 
250 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  32.31 
 
 
258 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  35.1 
 
 
265 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  27.8 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  29.74 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  29.74 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  29.74 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  29.74 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  29.74 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  29.74 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  29.88 
 
 
277 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  34.08 
 
 
284 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  29.3 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  30.19 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  28.88 
 
 
264 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  25.83 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  30.67 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  31.53 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  28.94 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  28.09 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  28.72 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  24.4 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3259  hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5347  hypothetical protein  30.2 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>