18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3735 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  73.1 
 
 		 606 aa  956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  100 
 
 		 604 aa  1268    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  60.07 
 
 		 604 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  44.17 
 
 		 711 aa  505  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  44.19 
 
 		 699 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  43.55 
 
 		 733 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  29.22 
 
 		 1421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  28.76 
 
 		 1413 aa  251  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  28.64 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  24.53 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  21.56 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  22.83 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 408 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 446 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 396 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 370 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>