18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3376 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3376  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0434  hypothetical protein  36.02 
 
 
199 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.422566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0128  hypothetical protein  35.87 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1637  hypothetical protein  32.24 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1948  hypothetical protein  39.6 
 
 
204 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0566548 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1310  hypothetical protein  31.72 
 
 
192 aa  89  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000335013  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1099  hypothetical protein  30.65 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1087  putative chorismate binding enzyme  33.6 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3993  hypothetical protein  31.63 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4032  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3887  hypothetical protein  31.96 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.88 
 
 
599 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.94 
 
 
599 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.66 
 
 
599 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  30.77 
 
 
594 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  25.63 
 
 
591 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  33.77 
 
 
596 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.76 
 
 
599 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>