13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1041 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1477  hypothetical protein  96.22 
 
 		 344 aa  698    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.192207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  803    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0084  hypothetical protein  43.68 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2650  replication initiation factor  25.51 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1182  hypothetical protein  75.76 
 
 		 66 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000254148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1039  hypothetical protein  28.76 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3699  hypothetical protein  28.98 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0100  hypothetical protein  24.55 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3067  replication initiation factor  25.08 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0900674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2276  replication initiation factor  26.7 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00843988  hitchhiker  0.00603168 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1569  hypothetical protein  23.95 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.409726  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3581  hypothetical protein  24.36 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.283892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0392  hypothetical protein  24.18 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.375122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>