21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0237 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2769  phage transcriptional activator, Ogr/delta  52.24 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278918  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1475  phage transcriptional activator, Ogr/delta  52.24 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0527212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1278  phage transcriptional activator, Ogr/delta  47.22 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  59.26 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2939  zinc-finger protein  45.83 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  6.930430000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0895  transcriptional activator Ogr/delta  42.5 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.646461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0718  phage transcriptional activator, Ogr/delta  43.04 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2802  zinc-finger protein  48.15 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0358  phage transcriptional activator Ogr/delta  37.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  37.8 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1024  phage zinc-binding transcriptional activator  37.8 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  39.71 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  40.68 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0692  phage transcriptional activator, Ogr/delta  45.28 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  37.74 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  37.74 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  41.38 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  41.38 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  40.98 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0359  zinc-finger protein  38.96 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>