58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2305 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2305  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0859  protein of unknown function DUF340 membrane  64 
 
 
201 aa  254  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.502969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1823  protein of unknown function DUF340, membrane  64.5 
 
 
200 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0050  protein of unknown function DUF340 membrane  48.91 
 
 
200 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0144  protein of unknown function DUF340 membrane  46.73 
 
 
199 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3085  protein of unknown function DUF340 membrane  43.78 
 
 
197 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.643763  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2328  protein of unknown function DUF340, membrane  39.58 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07210  predicted membrane protein  37.57 
 
 
304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000277975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1394  protein of unknown function DUF340 membrane  39.66 
 
 
308 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000734675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0355  protein of unknown function DUF340 membrane  33.85 
 
 
199 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2478  protein of unknown function DUF340 membrane  31.98 
 
 
312 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75328  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1787  protein of unknown function DUF340 membrane  33.51 
 
 
314 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal  0.778551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1313  protein of unknown function DUF340 membrane  35.19 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21000  predicted membrane protein  31.64 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0847  protein of unknown function DUF340 membrane  33.92 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1190  protein of unknown function DUF340 membrane  30.82 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0812  protein of unknown function DUF340, membrane  40.78 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003756  membrane protein  32.54 
 
 
301 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02630  hypothetical protein  32.54 
 
 
301 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1574  protein of unknown function DUF340, membrane  41.84 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0324  protein of unknown function DUF340 membrane  29.63 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0202278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1974  protein of unknown function DUF340 membrane  31.52 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0612  protein of unknown function DUF340, membrane  43.56 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454332  normal  0.780687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1667  protein of unknown function DUF340 membrane  33.53 
 
 
298 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104731  normal  0.791329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1708  hypothetical protein  31.52 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0721  hypothetical protein  30.05 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2616  hypothetical protein  32.52 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1592  hypothetical protein  32.52 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2700  protein of unknown function DUF340 membrane  32.52 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0605  protein of unknown function DUF340 membrane  40.78 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1005  hypothetical protein  32.14 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.85615  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0939  hypothetical protein  32.14 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1056  hypothetical protein  32.14 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0718  protein of unknown function DUF340, membrane  31.28 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2768  protein of unknown function DUF340 membrane  32.52 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00885  hypothetical protein  32.52 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00879  predicted transporter  32.52 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0947  hypothetical protein  32.52 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2722  protein of unknown function DUF340 membrane  32.53 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1035  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0978  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0903  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.469991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0973  hypothetical protein  31.63 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1036  hypothetical protein  31.63 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2457  hypothetical protein  32.52 
 
 
299 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98715  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0241  protein of unknown function DUF340 membrane  28.4 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0595  protein of unknown function DUF340, membrane  32.71 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.636868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1391  protein of unknown function DUF340, membrane  31.29 
 
 
299 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1660  protein of unknown function DUF340 membrane  30.84 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.429066  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0598  protein of unknown function DUF340, membrane  36.27 
 
 
303 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189399  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3666  protein of unknown function DUF340, membrane  33.16 
 
 
302 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0928  protein of unknown function DUF340, membrane  41.94 
 
 
308 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.726506  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1966  protein of unknown function DUF340, membrane  35.58 
 
 
326 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0906  permease  36.36 
 
 
302 aa  59.3  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0657608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0630  hypothetical protein  32.32 
 
 
303 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2905  protein of unknown function DUF340 membrane  32.47 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1843  protein of unknown function DUF340 membrane  31.73 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1134  protein of unknown function DUF340, membrane  33.33 
 
 
288 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>