21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2630 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2630  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4770  transporter gate domain protein  53.54 
 
 
223 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4917  transporter gate domain-containing protein  53.3 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4845  transporter gate domain protein  53.3 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4918  transporter gate domain-containing protein  53.81 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4869  transporter gate domain protein  53.3 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.449114  normal  0.562871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04863  hypothetical protein  45.13 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001110  hypothetical protein  43.97 
 
 
245 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4775  putative transporter  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5838  putative transporter  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04199  conserved inner membrane protein  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000688041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4873  putative transporter  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3734  nucleoside recognition domain-containing protein  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00796252  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4929  putative transporter  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4558  putative transporter  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3666  nucleoside recognition domain protein  51.24 
 
 
227 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0226  hypothetical protein  44.75 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04161  hypothetical protein  51.31 
 
 
196 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000325835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0778  nucleoside recognition domain protein  49.51 
 
 
231 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0109514 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1335  putative endonuclease  41.67 
 
 
210 aa  135  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.156209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0764  hypothetical protein  29.89 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>