11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0273 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0273  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  700    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0355  hypothetical protein  70.85 
 
 
337 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4264  neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding  28.71 
 
 
357 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3198  hypothetical protein  23.21 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2754  hypothetical protein  19.57 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2799  hypothetical protein  22.02 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13061  normal  0.226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2500  hypothetical protein  23.72 
 
 
356 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4110  hypothetical protein  23.93 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00135507  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4071  hypothetical protein  23.93 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1005  hypothetical protein  22.92 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.784899  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0752  hypothetical protein  23.12 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0533997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>