17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0985 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0985  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  832    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1945  hypothetical protein  52.9 
 
 
407 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5532  hypothetical protein  42.4 
 
 
396 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4870  hypothetical protein  40.41 
 
 
955 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3426  hypothetical protein  42.01 
 
 
428 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00293967  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2992  hypothetical protein  39.9 
 
 
403 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4943  hypothetical protein  38.6 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4282  hypothetical protein  37.82 
 
 
415 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4176  hypothetical protein  38.17 
 
 
415 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.616398  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  32.51 
 
 
499 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2412  hypothetical protein  28.97 
 
 
333 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3543  hypothetical protein  27.07 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655246  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.43 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.17 
 
 
283 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0346  hypothetical protein  23.27 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.9 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  20.94 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>