16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4185 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  233  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  79.51 
 
 		 119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  70.73 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  72.36 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  71.54 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  70.25 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  57.66 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  55.93 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  62.71 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  61.86 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  56.52 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  47.86 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  38.83 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>