18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2808 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.691589  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3896  hypothetical protein  65.08 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0700  hypothetical protein  37.38 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0396  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  24.03 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0451465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0888  hypothetical protein  35.14 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53908  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.85 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.18 
 
 		 688 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.97 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  26.32 
 
 		 690 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 284 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.78 
 
 		 687 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 450 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4566  acetaldehyde dehydrogenase  33.72 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  hitchhiker  0.000386347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  24.64 
 
 		 690 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  24.64 
 
 		 690 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2411  acetaldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>