46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2423 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2200  hypothetical protein  65.98 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521677  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2287  protein of unknown function DUF339  67.06 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2797  hypothetical protein  65.88 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  44.9 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2702  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00765809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  60.26 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3036  hypothetical protein  51.52 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3831  hypothetical protein  53.03 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.539928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3315  hypothetical protein  53.03 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83082  normal  0.599148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2148  hypothetical protein  51.52 
 
 		 90 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3938  hypothetical protein  51.52 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4644  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3590  hypothetical protein  51.52 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.068021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1823  protein of unknown function DUF339  51.52 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0813209  normal  0.601393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  51.52 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4429  hypothetical protein  51.52 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.731953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3604  hypothetical protein  48.51 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  53.09 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  44.3 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1992  hypothetical protein  49.23 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4365  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0762  hypothetical protein  43.04 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0789  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0308696  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2330  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2468  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0664  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292357  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5590  hypothetical protein  49.23 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.678134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2891  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6852  protein of unknown function DUF339  48.48 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.493884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1745  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0503  TPR repeat-containing protein  48.48 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1833  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0385386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1625  hypothetical protein  48.48 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2482  hypothetical protein  43.94 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2321  hypothetical protein  43.94 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  36.76 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  36.76 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  41.51 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  30.99 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  26.51 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  26.51 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  26.51 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  26.67 
 
 		 90 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>