39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1601 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  35.35 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  35.35 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  35.57 
 
 
202 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  33 
 
 
216 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4922  hypothetical protein  32.31 
 
 
199 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131667  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  34.15 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  32.77 
 
 
330 aa  89  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  32.81 
 
 
220 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  31.36 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  37.9 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  31.05 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  36.29 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  35.48 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  35.48 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  39.62 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1232  hypothetical protein  27.67 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000655533  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  36.79 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  39.47 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  39.47 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  30.46 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1945  hypothetical protein  30.21 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  38.71 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  34.29 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0124  hypothetical protein  25.58 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  17.93 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4226  hypothetical protein  27.81 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2003  hypothetical protein  25.49 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0220  hypothetical protein  27.72 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.231447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0095  hypothetical protein  26.86 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4736  hypothetical protein  28.67 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00217507  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0038  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>