48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1134 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1134  acyl-CoA-binding protein  100 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0455  acyl-CoA-binding protein  82.14 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628298  normal  0.491613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0446  acyl-coA-binding protein ACBP  82.14 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0773  acyl-CoA-binding protein  77.11 
 
 		 84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859936  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0347  acyl-coA-binding protein ACBP  72.62 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3532  acyl-CoA-binding protein  69.88 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4041  acyl-CoA-binding protein  71.08 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3509  acyl-CoA-binding protein  69.88 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3085  putative acyl-CoA-binding protein  61.9 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2000  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1305  acyl-coA-binding protein ACBP  60.71 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150747  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2522  acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2466  acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1239  acyl-coA-binding protein ACBP  59.52 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451854  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2078  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1947  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2065  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6031  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2046  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1231  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.162101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1358  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3227  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.457766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1366  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.322711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2085  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1583  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2611  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5355  Acyl-CoA-binding protein, ACBP  58.33 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2484  acyl-coA-binding protein ACBP  54.76 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515409  hitchhiker  0.000620664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1653  putative acyl-CoA-binding protein  54.76 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192969  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0123  acyl-coA-binding protein ACBP  54.76 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000595584  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1366  acyl-CoA-binding protein  53.57 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3734  acyl-CoA-binding protein  59.77 
 
 		 86 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1940  acyl-CoA-binding protein AcbP  55.95 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0103  acyl-CoA-binding protein  54.22 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000596303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1394  acyl-CoA-binding protein  53.01 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971038  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0342  acyl-CoA-binding protein  59.7 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0394  acyl-CoA-binding protein  47.56 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4032  acyl-coA-binding protein ACBP  45.78 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000477077  normal  0.553982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3254  acyl-CoA-binding protein  50 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.264963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31029  predicted protein  52.05 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32604  predicted protein  43.02 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000696357  normal  0.053185 
 
 
-
 
NC_006686  CND03160  long-chain fatty acid transporter, putative  38.46 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01420  long-chain fatty acid transporter, putative  34.48 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34529  predicted protein  44.29 
 
 		 394 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2596  acyl-CoA-binding protein  34.94 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07911  phosphatidylserine decarboxylase  33.75 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14734  predicted protein  38.1 
 
 		 211 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.605369 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05904  Acyl CoA binding protein family (AFU_orthologue; AFUA_2G11060)  31.25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.979863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>