13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4264 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4264  neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding  100 
 
 
357 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4071  hypothetical protein  28.1 
 
 
367 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4110  hypothetical protein  27.79 
 
 
367 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00135507  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0355  hypothetical protein  29.12 
 
 
337 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0273  hypothetical protein  28.71 
 
 
343 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1443  hypothetical protein  26.56 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1005  hypothetical protein  25.1 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.784899  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2500  hypothetical protein  22.91 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3198  hypothetical protein  23.85 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2799  hypothetical protein  21.66 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13061  normal  0.226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2754  hypothetical protein  22.63 
 
 
353 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0415  hypothetical protein  21.63 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21331  hypothetical protein  20.38 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>