20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2531 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2531  50S ribosomal protein L25  100 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4741  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  58.06 
 
 		 198 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3523  Ribosomal protein L25-like protein  59.38 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2054  50S ribosomal protein L25  58.06 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0736  50S ribosomal protein L25  50.98 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0707  50S ribosomal protein L25  54.84 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3283  50S ribosomal protein L25  52.58 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228774  normal  0.044405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2818  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  39.02 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1635  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.37 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0092  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  37.35 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3653  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  36.47 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00224871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0142  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  39.76 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2257  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  30.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2415  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  27.84 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.203941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1291  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.67 
 
 		 215 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1164  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.67 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2003  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  37.97 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000475903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0167  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.12 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1803  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  25.68 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2145  ribosomal protein L25  25.68 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>