55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2240 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 		 159 aa  320  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  57.43 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  47.26 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  45.33 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  44.59 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  35.03 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  40.56 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  37.06 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  38.69 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  35.1 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  37.68 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  35.53 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  34.44 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  37.32 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  35.14 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  37.32 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  37.9 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  27.81 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  38.64 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  32.12 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  33.76 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  32.62 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  28.3 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  34.78 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  34.59 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  36.52 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  31.58 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  31.78 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  29.13 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  29.93 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  33.61 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  29.66 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  36.43 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  31.06 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  35.23 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  35.23 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  35.23 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0858  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  28.24 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  31.86 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1960  flagellar assembly protein FliW  35.34 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  28.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1592  flagellar assembly protein FliW  36.61 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  30.77 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0412  flagellar assembly protein FliW  33.61 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  30.51 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  25.78 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1068  flagellar assembly protein FliW  29.46 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  31.58 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  29.41 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>