18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0945 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0945  metallophosphoesterase  100 
 
 
330 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1390  metallophosphoesterase  44.31 
 
 
324 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.132933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  40.5 
 
 
330 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1813  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
261 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00110244  normal  0.670349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  41.47 
 
 
695 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.23 
 
 
413 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  24.02 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  26.14 
 
 
404 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  24.02 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.02 
 
 
413 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  23.51 
 
 
428 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>