38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2991 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2991  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3297  hypothetical protein  43.84 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.816011  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0288  hypothetical protein  45 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4111  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0102  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0103  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1707  hypothetical protein  43.06 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4487  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4368  hypothetical protein  39.24 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4410  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0740873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4417  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4419  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4304  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4334  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.057731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4057  protein of unknown function DUF904  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5383  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03762  hypothetical protein  39.24 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0110  protein of unknown function DUF904  40 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.470283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0162  hypothetical protein  40.51 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0176  protein of unknown function DUF904  40.51 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4796  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000154448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4090  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4463  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.495871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4160  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00720  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03813  hypothetical protein  39.24 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4045  hypothetical protein  41.77 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3801  protein of unknown function DUF904  40 
 
 
80 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2259  hypothetical protein  36.25 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0188652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1177  hypothetical protein  48.28 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0717108  normal  0.950912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0412  hypothetical protein  40.3 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.424195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001752  hypothetical protein  38.75 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000892974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3319  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0386046  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1133  hypothetical protein  41.38 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3296  protein of unknown function DUF904  37.93 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0287  hypothetical protein  43.33 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00115516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4191  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00133258  normal  0.402597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0965  hypothetical protein  36.21 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00203776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>