12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1898 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1898  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  248  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  38.36 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  33.72 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  40 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  30.43 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  31.52 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  31.31 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  34.21 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>