11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3394 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3394  peptidase S41  100 
 
 		 477 aa  998    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0567862  normal  0.566348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6359  peptidase S41  26.94 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4303  peptidase S41  34.53 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.848815  normal  0.0435796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03133  hypothetical protein  35.43 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2080  hypothetical protein  24.59 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2234  hypothetical protein  24.59 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2017  hypothetical protein  25.91 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10453  hypothetical protein  23.2 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03134  hypothetical protein  26.52 
 
 		 162 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  25.48 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0248  hypothetical protein  22.97 
 
 		 601 aa  45.1  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.606779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>