13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2983 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2983  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.206465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2753  hypothetical protein  55.91 
 
 
196 aa  216  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2007  hypothetical protein  53.8 
 
 
209 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000443112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2112  hypothetical protein  48.07 
 
 
205 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6206  hypothetical protein  51.32 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0219288  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2298  hypothetical protein  48.62 
 
 
194 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6159  hypothetical protein  46.15 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3137  hypothetical protein  48.77 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0662  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2283  hypothetical protein  42.47 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6367  hypothetical protein  41.3 
 
 
199 aa  151  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0052  hypothetical protein  43.65 
 
 
199 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.79454  normal  0.653619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1570  hypothetical protein  38.71 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>