21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0543 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  100 
 
 		 266 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  44.23 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  40.52 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0244  S1/P1 nuclease  35.23 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  34.87 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  29.03 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  30.17 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  32.8 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  31.25 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  31.23 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  28.01 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  30.15 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  27.61 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02540  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 393 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  26.71 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  28.57 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5343  phospholipase C/P1 nuclease domain-containing protein  25.98 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.298135 
 
 
-
 
NC_003296  RS01677  putative signal peptide protein  29.89 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1908  hypothetical protein  25.9 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>