38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2636 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2636  microcompartments protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0901  ethanolamine utilization protein  46.2 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2231  polyhedral body protein  38.17 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2390  polyhedral body protein  38.17 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2277  polyhedral body protein  37.63 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0109336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2224  polyhedral body protein  37.63 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0143783  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2177  polyhedral body protein  37.1 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2295  propanediol utilization protein PduT  42.48 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0085  microcompartments protein  35.68 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1916  microcompartments protein  33.88 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1244  microcompartments protein  38.92 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  32.04 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0360  microcompartments protein  34.81 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3265  putative propanediol utilization protein PduT  34.76 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4895  microcompartments protein  37.84 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1371  microcompartments protein  32.61 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1303  microcompartments protein  36.72 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3269  microcompartments protein  36.26 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.942262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1366  microcompartments protein  30 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  28.96 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1939  microcompartments protein  30.34 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3272  propanediol utilization protein (PduT)-like  31.46 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5812  microcompartments protein  32.28 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  26.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  30.59 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  27.12 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  32.22 
 
 		 96 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  26.78 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  26.78 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  28.32 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  33.85 
 
 		 96 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  29.7 
 
 		 100 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  29.74 
 
 		 262 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  23.89 
 
 		 276 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>