14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2159 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  24.91 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  24.91 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  26.96 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  25.18 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  26.77 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  23.05 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  24.51 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  23.43 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  32.14 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  26.02 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  24.62 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>