42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1645 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1645  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  864    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3127  glycosyl transferase family 2  51.06 
 
 
365 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3123  hypothetical protein  46.24 
 
 
362 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3122  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.63 
 
 
516 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3126  hypothetical protein  39.84 
 
 
126 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1036  hypothetical protein  44.05 
 
 
98 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  23.43 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.49 
 
 
370 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.97 
 
 
366 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  22.97 
 
 
366 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  22.49 
 
 
370 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
677 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 
365 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
359 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
897 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1288  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895631  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  26.84 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
397 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  27.7 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  24.13 
 
 
797 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8532  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000714646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0383  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
667 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.542289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
644 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
263 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
857 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
438 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
252 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 
355 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>