18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1490 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1490  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25430  hypothetical protein  48.72 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0173874  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1686  hypothetical protein  43.59 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11320  hypothetical protein  39.74 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.67 
 
 
359 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00540  hypothetical protein  31.43 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2374  hypothetical protein  32.86 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0391  hypothetical protein  30.88 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3282  hypothetical protein  32.86 
 
 
78 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1402  hypothetical protein  42.22 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2981  hypothetical protein  36.62 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1131  hypothetical protein  28.99 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3496  hypothetical protein  33.33 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.77797e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3434  hypothetical protein  32.39 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000130296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2659  hypothetical protein  33.8 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.072724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0681  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000119094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25110  hypothetical protein  35 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.571099  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2040  hypothetical protein  27.78 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>