16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0265 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  33.87 
 
 
318 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  38.32 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  32.86 
 
 
336 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  34.86 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  34.91 
 
 
315 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  42.86 
 
 
413 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  33.94 
 
 
345 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  32.65 
 
 
439 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  30.77 
 
 
436 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1371  hypothetical protein  27.4 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  29.36 
 
 
444 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  35 
 
 
444 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0164  hypothetical protein  26.5 
 
 
936 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00430  hypothetical protein  28.57 
 
 
936 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0950  hypothetical protein  40.62 
 
 
633 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0249813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>