14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2546 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2546  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0971  hypothetical protein  90.94 
 
 
277 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3122  hypothetical protein  55.07 
 
 
284 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2345  hypothetical protein  53.62 
 
 
282 aa  321  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.0203272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1402  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201679  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0680  hypothetical protein  33.82 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2218  hypothetical protein  33.09 
 
 
317 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.545935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1895  hypothetical protein  32.01 
 
 
317 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457174  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2465  hypothetical protein  31.14 
 
 
279 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2120  hypothetical protein  30.14 
 
 
309 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0983  hypothetical protein  31.74 
 
 
315 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3499  hypothetical protein  29.69 
 
 
342 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2066  hypothetical protein  30.82 
 
 
316 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615053  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0007  hypothetical protein  27.54 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>