15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1804 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 163 aa  323  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0710  rod shape-determining protein MreD  52.2 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0532  hypothetical protein  44.52 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1165  hypothetical protein  44.81 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0572  hypothetical protein  38.04 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.726102  normal  0.420167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0865  hypothetical protein  38.04 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0818  hypothetical protein  41.72 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  36.36 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  38.36 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  35.06 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  40.35 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  31.46 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  29.76 
 
 		 163 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  28.85 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  36.51 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>