13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1744 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1744  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
372 aa  774    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.311392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1852  hypothetical protein  41.34 
 
 
383 aa  319  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00720  hypothetical protein  41.24 
 
 
388 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.79 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  33.52 
 
 
409 aa  189  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0708  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.37 
 
 
385 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  27.17 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  27.17 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  27.17 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.74 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  27.13 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  28.19 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  23.98 
 
 
329 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>