23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0595 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0595  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03883  Radical enzyme activating protein  53.47 
 
 		 148 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0093  hypothetical protein  49.32 
 
 		 206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2805  hypothetical protein  43.15 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.495523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0207  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.71 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.911431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1808  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3515  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  26.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2385  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2902  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.568688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2687  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1700  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0627  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2810  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2744  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.23 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0965  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  26.19 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase activating protein  31.48 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.887207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0923  hypothetical protein  23.85 
 
 		 152 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00139722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1781  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.14 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.277436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03520  hypothetical protein  23.42 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.399946  normal  0.740791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3582  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.24 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4659  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.24 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3289  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.15 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>