25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1956 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  71.15 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  71.15 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 54 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1473  CopG family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297007  normal  0.896918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  44 
 
 		 59 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  47.5 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  47.5 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  51.16 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2232  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 48 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000030214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0981  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  45.95 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0146172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  45 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0102  CopG family transcriptional regulator  50 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.433684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0889  CopG domain protein DNA-binding domain protein  38.1 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.259319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  42.31 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1448  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2564  conserved hypothetical protein  53.33 
 
 		 42 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.644185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>