16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0972 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 347 aa  704    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00933652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.11 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  52.37 
 
 		 338 aa  358  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 		 338 aa  348  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 		 338 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.02 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0526  GTP-binding protein  24.75 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  34.09 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>