18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0450 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  100 
 
 
589 aa  1158    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  27.61 
 
 
536 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  28.11 
 
 
536 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  25.55 
 
 
535 aa  159  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  28.57 
 
 
536 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  25.28 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  24.94 
 
 
580 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  25.21 
 
 
618 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  22.66 
 
 
581 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  21.21 
 
 
544 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  22.16 
 
 
578 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  23.32 
 
 
579 aa  70.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  23.4 
 
 
583 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  23.76 
 
 
566 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  22.97 
 
 
578 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 
576 aa  53.9  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  20.26 
 
 
533 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  22.09 
 
 
538 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>