24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1656 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  633    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1839  hypothetical protein  55.6 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  39.19 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1185  hypothetical protein  35.69 
 
 		 658 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0534773  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20311  hypothetical protein  37.55 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2530  hypothetical protein  39.45 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1319  hypothetical protein  39.3 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1676  hypothetical protein  37.35 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1421  hypothetical protein  39.62 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1274  hypothetical protein  34.33 
 
 		 658 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.367202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1678  hypothetical protein  34.94 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00270694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2121  hypothetical protein  38.13 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.9714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2301  hypothetical protein  38.13 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00584965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2275  hypothetical protein  38.13 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.969243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2059  hypothetical protein  38.13 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.302728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2055  hypothetical protein  38.13 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2307  hypothetical protein  37.74 
 
 		 379 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2385  hypothetical protein  36.96 
 
 		 384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3067  hypothetical protein  37.74 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1667  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2258  hypothetical protein  37.74 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  32.93 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 866 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2738  methyltransferase type 11  26.33 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>