18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0653 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  37.72 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  28.62 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  27.55 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  26.21 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  24.32 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  27.68 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0027  hypothetical protein  27.12 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  29.02 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  26.87 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  25.75 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  25.95 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  27.39 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  25.12 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  23.76 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  27.43 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  30.89 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>