18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1336 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1336  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 48 aa  97.1  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  93.75 
 
 		 48 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  93.75 
 
 		 48 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  91.67 
 
 		 48 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 50 aa  87  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0235  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  87  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  81.25 
 
 		 48 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0988  50S ribosomal protein L32  81.25 
 
 		 48 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1773  50S ribosomal protein L32  72.92 
 
 		 49 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  43.75 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1953  50S ribosomal protein L32  48.84 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000656252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 57 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>