14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1077 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  53.32 
 
 		 620 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  52.85 
 
 		 620 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  56.8 
 
 		 636 aa  750    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  53.64 
 
 		 621 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1306    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  40.47 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 650 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  36.46 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  35.63 
 
 		 644 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  38.18 
 
 		 610 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 630 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 649 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  24.44 
 
 		 650 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  37.5 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>