11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0012 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686329  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05440  tRNA-Gln  92.96 
 
 
75 bp  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0015  tRNA-Gln  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.949379  hitchhiker  0.00177094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0024  tRNA-Gln  85.92 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000715589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0025  tRNA-Gln  84.51 
 
 
72 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0051  tRNA-Gln  96.43 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30190  tRNA-Gln  96.3 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.548182  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0014  tRNA-Gln  91.18 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0013  tRNA-Gln  91.18 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>