11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0028 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000573287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>