17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5031 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  71.96 
 
 
164 aa  167  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  51.15 
 
 
201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  62.18 
 
 
188 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  56.14 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  52.25 
 
 
182 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  54.29 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  54.46 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  48.82 
 
 
197 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  40.57 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  36.62 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  38.68 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  41.51 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  39.62 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3748  hypothetical protein  26.8 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286744  unclonable  0.000000761757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  34.52 
 
 
208 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>