32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4294 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  902    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  43.93 
 
 
335 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  41.1 
 
 
328 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  43.63 
 
 
318 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  38.37 
 
 
334 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  34.25 
 
 
334 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  34.5 
 
 
349 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  35.02 
 
 
361 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  33.64 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  33.64 
 
 
374 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  33.65 
 
 
339 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  38.49 
 
 
342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  34.35 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  35.26 
 
 
321 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  30.25 
 
 
323 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.13 
 
 
366 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  33.23 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  32.44 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  32.44 
 
 
319 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.58 
 
 
359 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.1 
 
 
380 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  30.03 
 
 
779 aa  86.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  31.91 
 
 
327 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  30.69 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  28.15 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.08 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  28.57 
 
 
331 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  29.59 
 
 
395 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  27.88 
 
 
316 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  24.91 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.55 
 
 
2449 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>