28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3496 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3496  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  359  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  23.81 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  26.8 
 
 
232 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  23.81 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  26.14 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  26.14 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  26.67 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  29.17 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  24.84 
 
 
232 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  23.96 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  23.96 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  25.49 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  22.15 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  22.15 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0336216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  23.96 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  23.96 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  24.03 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  22.92 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  21.52 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  26.23 
 
 
231 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  26.23 
 
 
231 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  21.88 
 
 
232 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  24.84 
 
 
241 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>