23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3333 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  216  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  52.7 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  45.71 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  39.56 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  42.67 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  44.16 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  39.76 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  39.53 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  42.31 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  39.74 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  38.37 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  35.9 
 
 
87 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  37.18 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  37.21 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  39.24 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  35.9 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  44.19 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0734  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184281  normal  0.283478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0754  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709746  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0740  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  30.77 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0093  hypothetical protein  32.43 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>