19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1710 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  55.48 
 
 
168 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  48.68 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  47.77 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  47.33 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  43.26 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  42.95 
 
 
155 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  45.32 
 
 
152 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  44.9 
 
 
155 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  44.9 
 
 
155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  44.52 
 
 
176 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  43.17 
 
 
158 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  41.84 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  38.1 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  47.37 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  37.3 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  38.89 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  37.96 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  41.18 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>