25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1068 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  100 
 
 
698 aa  1452    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  89.51 
 
 
699 aa  1309    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  66.95 
 
 
711 aa  952    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  39.15 
 
 
699 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  38.64 
 
 
698 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  38.98 
 
 
712 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  28.32 
 
 
950 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  26.83 
 
 
756 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  25.86 
 
 
744 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  32.21 
 
 
666 aa  90.9  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  30.89 
 
 
719 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  29.06 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  26.19 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  28.15 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  25.4 
 
 
882 aa  70.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  25.99 
 
 
331 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  28.25 
 
 
661 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  31.76 
 
 
330 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  26.36 
 
 
501 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  33.96 
 
 
319 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  27.19 
 
 
719 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  24.14 
 
 
357 aa  48.9  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  26.74 
 
 
390 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>